Кирха Ботенена построена, предположительно, около 1320 года. Алтарь нюрнбергской работы относится к началу XVI века.
В 1852 году строение было покрыто новой остроконечной крышей с четырьмя фронтонами. Имелось три колокола.
К весне 1989 года от здания оставалась только полуразрушенная башня, а территория заросла кустарником и травой. Кирха располагается в центре кладбища в посёлке Тростники, имеет статус объекта культурного наследия регионального значения.